يشرف مكتب المدير العام على الوظائف الإدارية والتشغيلية والتنسيقية اللازمة لدعم المدير العام ورئيس مجلس إدارة الهيئة العامة للطيران المدني. ويتولى المكتب إدارة المراسلات، وتنسيق التواصل الداخلي والخارجي، وتنظيم أنشطة المجلس واللجان، وضمان التواصل الفعّال مع الجهات الوطنية والإقليمية والدولية بما يتماشى مع الأهداف الاستراتيجية للهيئة.